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表观遗传学(Epigenetics)是一门研究基因表达及功能调控的遗传学分支,它关注的是在DNA序列不变的情况下,生物体如何通过化学修饰或者其他机制调整基因表达的方式,以及这些变化如何在细胞分裂过程中得以维持并可能传递给后代。表观遗传学的主要研究内容包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA调控、染色质重塑等现象。
1. DNA甲基化:DNA甲基化是最常见的表观遗传标记之一,主要发生在胞嘧啶残基的第5位碳原子上,形成5-甲基胞嘧啶。DNA甲基化会影响基因转录的活性,高甲基化区域通常与基因沉默相关。
2. 组蛋白修饰:组蛋白是包裹DNA的蛋白质,其上发生的化学修饰(如乙酰化、甲基化、磷酸化等)可以改变染色质的压缩程度,影响基因的可访问性,进而调控基因表达。
3. 非编码RNA调控:包括微小RNA(miRNA)、长非编码RNA(lncRNA)等,它们可以通过与mRNA或DNA结合,调控基因转录或翻译过程,从而影响基因表达。
4. 染色质重塑与三维结构:染色质高级结构的重塑,如拓扑结构域的形成与变化,会影响基因间的相互作用以及基因的表达调控。
近年来,表观遗传学已成为生物医学研究的热门领域,尤其在癌症、神经退行性疾病、精神障碍等复杂疾病的研究中扮演了重要角色。澎立生物表观遗传学平台可以提供以下服务支持表观遗传学靶点的开发:
● 表观遗传学靶点化合物筛选
● 新靶点的方法开发
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Writers
● Histone methyltransferase : eg. NSD
● Histone acetyltransferase: eg. CBP, p300
● Protein arginine methyltransferase: eg. MTA-cooperative PRMT5 assays
● RNA modification gene: eg. METTL3/14 assay
● Poly(ADP)-ribose polymerase: PARPs
Erasers
● Demethylase: eg. HDACs, KDMs
● Deubiquitinase: eg. DUB
Readers
● Bromo domain containing protein binding partner assays: eg. BRDs
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